温度对配合饲料的保管和贮存影响很大，因为配合饲料里存在营养物质和少量水分，为细菌的生存、繁殖提供了有利条件，高温下细菌体内酶的活性有1定程度提高,细菌活动性增强,大量繁殖,使配合饲料中的组成成分迅速分解，以致腐败变质，产生大量的有害物质，水产养殖动物吃了霉变的饲料，不仅会影响其正常生长，长期以往，有毒有害物质在水产养殖动物体内蓄积，后还会殃及消费者的身体健康。当温度低于10℃时，霉菌生长缓慢，高于30℃则生长迅速，配合饲料会迅速变质，因此，高温期间配合饲料应贮存在低温通风处。贮存饲料的库房应具有隔热、避光、防辐射等性能，因而库顶要有隔热层，周围种树遮荫，墙壁还要涂上白色以减少热量的吸收。
水产配合饲料有粉状，颗粒状，颗粒状又有软颗粒，硬颗粒，膨化颗粒。选择哪一种要看养殖对象的食性、摄食分式等特点，如鳗鲡料，属于粉状，粉料吸水后做成团状利于鳗鲡的摄食，但现在向驯食膨化颗粒料方向发展。现在鱼料多数是颗粒料，颗粒料优于粉料，适应于水中投喂，在水中营养损失小于粉料，同时降低水质的污染。
对轻微霉变饲料的处理：
1.辐射或暴晒法。对轻微霉变的原料用辐射或暴晒的办法处理，可破坏其中50%-90%的黄曲霉毒素。
2.酶解法。利用酶的专一亲和性，高效催化、降解黄曲霉毒素为无毒化he物。酶降解去除霉菌毒素效果好、实用性强，但酶易被高温或酸度所破坏且分解后的产物还可能有毒，因此需要注意。
3.吸附法。常用的吸附剂有沸石、活性炭等，这类吸附剂添加量大，有的有副作用，有的还吸附养分和抗生素。另一类是酵母细胞壁类产品。
4.物理化学法。利用中草yao熏蒸法，氧化剂法，乳酸菌和醋酸菌等微生物法，或补充硒等营养元素可降低黄曲霉毒素毒性。由于处理后仍有毒素残留，应限量饲喂，并添加黄菌霉毒素吸附剂。