亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing pcr,bsp)的dna甲基化检测方法具有较高可靠性及精确度,能精确得出片段中每一个cpg位点的甲基化状态。
实验原理
用亚硫酸氢盐处理基因组dna,未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。针对目标区域设计bsp引物进行pcr扩增,对扩增产物进行测序就可以判断哪些cpg位点发生了甲基化;一般将pcr产物克隆后进行测序成功率会比较高。
服务的流程
1. bsp引物设计:针对感兴趣的基因区域进行bsp引物的设计
2. 亚硫酸氢盐处理基因组dna:提取基因组dna并进行亚硫酸氢盐的转化
3. pcr扩增目的片段:bsp引物扩增感兴趣的区域
4. 克隆到载体:将pcr产物纯化后连接到载体上
5. 克隆测序:挑取阳性菌斑,提取质粒并测序(10个克隆)
6. 序列分析:对测序的结果进行比对和甲基化分析
项目周期
15-20个工作日
项目交付
1、提供完整实验报告
2、电泳图谱
3、测序图谱
4、序列比对图谱
5、分析数据
注意事项
1、客户提供:要调查的基因名称、种属,要调查的甲基化区域或位点;
2、样品要求:细胞≥105个;组织≥100mg;全血≥0.5ml;基因组dna ≥5ug;
3、所有样品建议干冰寄送,保持低温,保证样品质量;
4、每个检测片段序列长度不超过350bp。
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