测序仪之分析或打印出彩色测序图谱
北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 abi 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管,1.2kv预电泳5min,按编程次序自动进样,再预电泳(1.2kv,20min),在7.5kv下电泳2h。电泳结束后仪器会自动清洗,灌胶,进下一样品,预电泳和电泳。每一个样品电泳总时间为2.5h。电泳结束后仪器会自动分析或打印出彩色测序图谱。
北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。欢迎您致电联系我们获取更多优惠~~~
二代测序仪的操作流程
北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 abi 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
1)测序文库的构建(library construction)
首先准备基因组dna(虽然测序公司要求样品量要达到200ng,但是gnome analyzer系统所需的样品量可低至100ng,能应用在很多样品有限的实验中),然后将dna随机片段化成几百碱基或更短的小片段,并在两头加上特定的接头(adaptor)。如果是转录组测序,则文库的构建要相对麻烦些,rna片段化之后需反转成cdna,然后加上接头,或者先将rna反转成cdna,然后再片段化并加上接头。片段的大小(insert size)对于后面的数据分析有影响,可根据需要来选择。对于基因组测序来说,通常会选择几种不同的insert size,以便在组装(assembly)的时候获得更多的信息。
2)锚定桥接(surface attachment and bridge amplification)
solexa测序的反应在叫做flow cell的玻璃管中进行,flow cell又被细分成8个lane,每个lane的内表面有无数的被固定的单链接头。上述步骤得到的带接头的dna 片段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构,以供后续的预扩增使用。
3)预扩增(denaturation and complete amplification)
添加未标记的dntp 和普通taq 酶进行固相桥式pcr 扩增,单链桥型待测片段被扩增成为双链桥型片段。通过变性,释放出互补的单链,锚定到附近的固相表面。通过不断循环,将会在flow cell 的固相表面上获得上百万条成簇分布的双链待测片段。
4)单碱基延伸测序(single base extension and sequencing)
在测序的flow cell中加入四种荧光标记的dntp 、dna 聚合酶以及接头引物进行扩增,在每一个测序簇延伸互补链时,每加入一个被荧光标记的dntp就能释放出相对应的荧光,测序仪通过捕获荧光信号,并通过计算机软件将光信号转化为测序峰,从而获得待测片段的序列信息。从荧光信号获取待测片段的序列信息的过程叫做base calling,illumina公司base calling所用的软件是illumina’s genome analyzer sequencing control software and pipeline analysis software。读长会受到多个引起信号衰减的因素所影响,如荧光标记的不完全切割。随着读长的增加,错误率也会随之上升。
5)数据分析(data analyzing)
这一步严格来讲不能算作测序操作流程的一部分,但是只有通过这一步前面的工作才显得有意义。测序得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列,要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的contigs甚至是整个基因组的框架,或者把这些序列比对到已有的基因组或者相近物种基因组序列上,并进一步分析得到有生物学意义的结果。
北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。
测序仪
北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 abi 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
dna序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今 dna序列分析的主流。主要型号有373型测序仪、377型测序仪、310型、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。
北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。欢迎您致电联系我们获取更多优惠~~~
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