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日本别科是指设立在大学内的特别学习科，可以理解为大学内的专门针对外国人的日本语学习科。进入别科的学生和日本学生一起在大学校园内共同学习、生活，可以更深入的了解日本文化。目前在日本别科共有48所(为比较新的统计，有些陈旧统计为60所)，全部设立在私立大学之中。
日本语言学校是学习日本语的独立教育机构。日本语言学校分阶段教授学生日本语，同时进行系统的升学指导。日本语言学校在日本共有445所。
日本别科学校与日本语言学校的优、劣势比较
（一）日本别科学校优势
共享大学设施
留学生别科设立在大学校园内，留学生可以和日本学生在一起学习生活，可以更深入的了解日本文化。同时可以享受大学校园中的完善的教育设施，比如图书馆，体育馆，食堂，宿舍等等。
毕业后优先升入本大学学部、大学院
日本别科学校的学生熟悉校园环境，同时也有更多的机会接触本学校的其他学部、研究科的老师。如果在老师的准许下，别科期间也可以旁听一些学部或者大学院的课程，这些都提供了良好的条件，有利于学生在别科毕业后优先升学进入本学校的学部或者是大学院。甚至一些学校，在别科生升入本校学部或者大学院时，减免学生的报名费和入学金。
需要注意的是，有的私立大学别科要求只能升入本校的大学学部。