所谓“两票”，简单的说就是药品从生产企业卖到批发企业开一次增值税发票，批发企业卖到医疗机构再开一次增值税发票，以“两票”替代目前常见的“多票”。由于现行的药品购销规范强调票货同行、药品+发票+资金=三流合一。因此，两票制政策不仅是对购销发票的规定，也是对药品流通环节的限制，以达到压缩流通环节、削减中间费用、降低药品价格。
两票制对医药行业影响1、商业环境改变，弱肉强食两票制促使当前药品流通格局发生重大调整，对于做临床产品分销业务的企业来说，中间多余的商业实体都将被压缩掉，包括过票公司和二级及以下代理商，只会剩下作为一级商业的医药企业。药品发票流将简化为：生产商—医药企业—医院。由此可看出，医药行业的商业环境演变为：强者愈强、弱者消亡。
理由有三点：
① 商业集中度将进一步提高，大型医药企业将变得更大。
② 过票公司必然因无票可过而消亡。
③ 二级及以下代理商将有三种结果：最好的选择是被大型企业收购成为其子公司；其次是变成物流公司，利用原有的基础继续接受储运业务、不涉及药品发票；最后是没有业务自动消失。
解决方法：
解决药企税收成本，提高行业竞争力的最好方式便是对企业进行纳税筹划。医药行业自2007年实行两票制后，更方便的可以享受税收优惠政策。那么两票制之后医药行业可享受哪些增值税和个人所得税的税收优惠政策呢？
目前，对于医药行业实现利润最大化最好的方法就是选择到一个税率极低的”税收洼地“注册公司，将所有业务转移到新的税收洼地，降低企业的总税负。【陈183-757-04265】比如可以到重庆正阳工业园区注册公司或者配套个人独资企业，享受核定征收。
园区同时享受国家及地方诸多优惠政策：少数民族政策、西部大开发政策、三峡移民政策、国家级贫困扶持政策、革命老区政策等。企业在园区享受的税收优惠相当大。园区企业增值税以地方留存的30%~50%扶持；企业所得税以地方留存的30%~50%给予扶持；个人独资企业（营改增）小规模的可以申请核定征收，核定征收之后享受个税税率0.5%~3.1%【陈183-757-04265】。且实行注册制、无行业与门槛限制，全国企业均可入驻园区。
医药企业可到到重庆正阳工业园区配套个人独资企业，如注册某某医疗科技中心、某某健康管理咨询中心等。参考经营范围：“药品销售，生物技术推广；从事医疗、医药技术产品技术研究及相关成果的技术转让，组织医药学术交流活动；药品信息咨询(不含互联网信息)；市场营销策划，会务及展览服务，公关活动策划，企业管理咨询，市场调研，企业营销策划；计算机软硬件的开发，网站设计推广，网站建设；设计、制作、代理发布国内外广告；销售：办公用品、医药用品、日用百货、电子产品(不含电子出版物)、工艺美术品（不含文物）、仪器仪表、玻璃制品、环保设备、通信设备。
在全面实施“两票制”的当下，医药企业的财税处理能力决定了模式转型能否成功的关键。善于运用税收优惠政策为企业实现利润最大化和税负最低化，是企业实现自身强大的创新能力和经济活力的不二之路。