2018年8月23日，国家卫生健康委员会、工业和信息化部、公安部、财政部、商务部、国家税务总局、国家市场监督管理总局、国家医疗保障局、国家中医药管理局等九部委联合印发了《关于印发2018年纠正医药购销和医疗服务中不正之风专项治理工作要点的通知》（国卫医函〔2018〕186号，以下简称《通知》）。《通知》将规范药品耗材产销用行为，健全供应保障体系，加强医疗服务监管，规范医务人员行为，推进医药代表备案管理，构建回扣治理体系，依托纠风机制综合施策，确保工作取得实效。此次新规颁布后，医药行业在治理不正之风的同时，不得不重视税务风险。
四大原因造成医药企业税务风险高
一、营改增的影响
2016年5月起，营改增全面推开，所有营业税征税项目改征增值税，对企业的最大影响来自于税率调整和增值税抵扣链条的引入。所有增值税专用发票均从全国联网的增值税系统开具，并且要求交易的票、帐、货相符；并且增值税抵扣链条完整，货物进出记录清晰可查。因此，不论是药品生产企业，还是代理商，都想尽办法以看似真实交易开具的发票冲抵成本和费用，涉税风险就像埋好的定时炸弹，只是没到引爆时候。
二、两票制的影响
2017年1月，国务院办公厅在《关于进一步改革完善药品生产流通使用政策的若干意见》中提出，在试点的基础上，争取2018年在全国推行两票制。两票制，是指国家要求药品从出厂到进入医院，只能开具两次发票。其中，生产企业向流通企业开具的发票为第一票，流通企业到医疗机构开具的发票为第二票。此项规定主要目的是为了打击医药行业盛行的过票、洗钱行为，压缩药品流通环节，净化经营环境。
两票制执行，迫使药品生产企业从之前的低开票转变为高开票；企业的账务处理和经营模式面临挑战。因此，造成了诸多地方医药商业因为资金链问题、税票问题、利润问题而停业整顿、或直接经营不下去。
三、打虚打骗专项行动的影响
打虚打骗就是打击虚开发票和骗取出口退税。医药行业作为虚开增值税专用发票的重灾区，每年都被确定为打虚打骗的重点行业。总局近年公布的打虚打骗典型案例少不了药企的身影；特别是2016年，10个典型案例中，药企就占了4个。
四、实行税收黑名单制度的影响
2014年7月，税务总局发布《重大税收违法案件信息公布办法》，建立税收违法黑名单公布制度，惩戒严重涉税违法行为；其中就包括虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，以及虚开普通发票100份或者金额40万元以上的。2014年12月，在国家发改委的协调下，税务总局与21个中央部委联合签署了《关于对重大税收违法案件当事人实施联合惩戒措施的合作备忘录》，地方各级税务局也牵头签署了本地联合惩戒合作备忘录。2016年修订后，共有联合惩戒措施28项，分部门实施；包括：向社会公布违法信息，纳税信用等级降为d级，阻止出境，任职限制，融资参考，禁止高消费，限制、甚至禁止多项经营行为，多部门从严监管，等等。医药行业作为虚开高发行业，一旦涉税行为被税务局认定虚开骗税，企业和相关责任人都将寸步难行，年关难过。
以上政策的颁布给医药行业造成了前所未有的挑战，监管势头更是越来越猛。据统计，全国1.19万家药品企业，仅2017年就消失了1000家之多。大小生产企业面临经营挑战和艰难抉择。专家预测，未来将有50%甚至更多药企会被合规监管和无情市场所淘汰。
药企积极应对税务风险管理挑战
一、做好事前预警
良好的财税处理能力关乎企业生存和长远发展。医药企业主要涉及增值税和企业所得税处理。增值税方面，要尽量扩大取得增值税进项发票的范围，对所取得发票的真实性进行严格审核；同时，对购进货物和服务进行跟踪管理，对不符合抵扣条件的，及时转出。企业开展营销活动，应与服务提供机构签订协议，并要求按服务项目提供合规的增值税专用发票，保留完整的营销活动纪录。企业所得税方面，企业应充分利用税收优惠政策，如高新技术企业税率优惠，科研开发加计扣除，企业聘用残疾人员工资费用的工资加计扣除等。
二、探寻合规运营模式
医药行业营销过程决定了中间代理环节不可或缺，但必须符合合规监管要求。医药行业正在探索合同销售模式（cso）,推动医药营销往专业化、学术化方向发展，逐步淘汰广受诟病的带金销售。但是，cso同样面临营销费用的变现及成本控制问题，因此，应积极取得地方政府和行政管理部门的理解和支持，确保医药行业的改革有序前行、健康发展。
三、规范发票及凭证的审核与管理
在业务推广方面，对于会议费，除了保留发票外，应当留存反应会议召开时间、地点、参会人员、议程、现场照片、签到表等反应会议真实性的相关证明文件，企业财务人员要加强对相关凭证的收集和管理，要杜绝购买发票抵扣税款的行为发生。
四、引入税法培训、专家支持
由于药企税案往往涉及虚开增值税专用发票犯罪，税务机关必须将涉嫌犯罪的案件移交公安机关处理；因此，涉税案件刑事风险较大，药企应当及早了解相关法律规定，避免案件检查和侦查过程中自证其罪。一旦涉税问题被纳入行政、刑事执法程序，企业要及时寻求专业协助，维护合法权益，避免处置不当或不及时，后果难以挽回。
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