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chromaspro是常用dnf序列分析软件chromas的pro专业版,适用于高达几兆碱基的dna序列装配项目,以及基本的序列编辑和分析,它能够汇集来自sanger测序仪(如abi,454和illumina下一代测序仪)的数据,如果有8gb ram可用,多可达1,000,000个序列,chromaspro不免费,但是可以免费试用14天。
1、applied biosystems .ab1,staden chromatogram(scf和ztr),454 sff,fasta,fastq,embl,genbank,swissprot,genpept,gcg rsf和纯文本格式中的笔序列。
2、以.ab1,.scf,.fasta和.fastq格式保存序列。
3、使用图形界面组合重叠序列,生成共识并突出显示编辑的歧义。
4、使用质量数据自动删除低质量序列以改进序列组装。
5、使用参考序列作为装配的支架。
6、生成限制性站点和片段映射,并列出切割器,非切割器和片段。
7、在g + c框架图的帮助下绘制开放阅读框,并一键翻译orf。
8、打印色谱图,限制性位点和片段图,以及打开阅读框架图。
9、通过ncbi网站进行核苷酸和蛋白质blast搜索。
10、通过与clustalw连接来执行多重对齐。
11、反向和补体序列和色谱图。
12、通过精确匹配或优秀比对搜索序列。
13、编辑核苷酸序列时显示翻译。
14、执行反向翻译并绘制核苷酸简并。
15、绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
16、复制色谱图部分的图像以粘贴到文档或演示文稿中。
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
映射开放阅读框,由g+c框架图辅助,并用一次点击翻译orfs。
打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
通过ncbi网站进行核苷酸和蛋白质blast搜索。
与clustalw接口执行多个对齐。
系统需求
compatible with windows xp, vista, 7, 8, 10.
chromaspro适用于dna序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从sanger序列器,比如abi,454和illumina下一代序列器中组装数据,如果有8gb的可用内存,则多可组装1,000,000个序列。
chromaspro具体功能
? 打开applied biosystems .ab1, staden chromatogram (scf and ztr), 454 sff, fasta, fastq, embl, genbank, swissprot, genpept, gcg rsf和纯文本格式中的序列。
? 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
? 使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
? 使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
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chromaspro是一款好用的dna测序图谱软件,软件主要适用于专业的生物学人员使用,软件适用于测序的项目可以高达几百万碱基,并拥有实用的基本序列编辑、序列分析、生成限制位点和片段图以及搜索序列等多种功能,是您进行专业研究的好帮手。
以应用生物系统、staden色谱图(scf)、megabace (esd)、fasta、embl、genbank、swissprot,、genpept、gcg rsf和纯文本格式打开和保存序列。
将重叠序列组装一致,自动显示含糊不清的序列并编辑。
用高质量数据自动消除低质量序列并提高序列集合。
查看检测基因型文件。
生成限制位点和片段图,并且列举切割、无切割和片段。
染色体图开放阅读框,借助g+c框架图,点击一下即可翻译orfs。
打印色谱图,限制位点和片段图,并且打开阅读框架图。
执行核苷和蛋白质blast,通过ncbi网站搜索。
通过clustalw的界面执行多序列。
逆向&补充序列和色谱图。
通过准确匹配或优秀队列搜索序列。
当编辑核苷酸系列时显示翻译。
执行反向翻译和标出核苷酸退化。
划分蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱图截面的图形粘贴到文档或演示文件中。
反向互补序列和色谱图。
通过精确匹配或优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
chromaspro具体功能
? 打开applied biosystems .ab1, staden chromatogram (scf and ztr), 454 sff, fasta, fastq, embl, genbank, swissprot, genpept, gcg rsf和纯文本格式中的序列。
? 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
? 使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
? 使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
chromaspro是一款免费的dna测序项目管理软件,为用户提供了多种分析序列所需工具,可以从多个程序和文件类型导入序列的详细信息,支持编辑数据以提高序列组装。采用峰图的转换模式对基因变化的点、线、区域进行直观的分析。
chromaspro适用于dna序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从sanger序列器,比如abi,454和illumina下一代序列器中组装数据,如果有8gb的可用内存,则多可组装1,000,000个序列。
chromaspro适用于dna序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从sanger序列器,比如abi,454和illumina下一代序列器中组装数据,如果有8gb的可用内存,则多可组装1,000,000个序列。
chromaspro具体功能
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? 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
? 使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
? 使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
? 使用参考序列作为组装的支架。
? 生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
? 映射开放阅读框,由g+c框架图辅助,并用一次点击翻译orfs。
? 打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
? 通过ncbi网站进行核苷酸和蛋白质blast搜索。
? 与clustalw接口执行多个对齐。
? 反向互补序列和色谱图。
? 通过精确匹配或优对齐搜索序列。
? 编辑核苷酸序列时显示翻译。
? 进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
? 绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
? 复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。