已安装使用“金税三期个人所得税扣缴系统”的扣缴义务人登录系统可进行在线自动升级软件，软件安装完成后，首先需要进行系统初始化注册。初始化注册的过程，即是通过税号从税局网络上获取最新的企业信息，保存到本地客户端的过程。会计注意这3个个税问题
1、个人所得税申报，需进行代扣代缴申报的所得包括：
一、工资、薪金所得；二、劳务报酬所得；三、稿酬所得；四、特许权使用费所得；五、利息、股息、红利所得；六、财产租赁所得；七、财产转让所得；八、偶然所得；其中，大部分用户都只需要填写工资薪金所得中的《正常工资薪金》；企业有外籍员工的需要填写《外籍人正常工资薪金》；年终会填写《全年一次性奖金》。部分企业也会填写《劳务报酬》所得。
2、个人所得税申报，免税有哪些？
《个人所得税法》规定了免税所得的范围。一、省级人民政府、国务院部委和中国人民解放军军以上单位，以及外国组织、国际组织颁发的科学、教育、技术、文化、卫生、体育、环境保护等方面的奖金；二、国债和国家发行的金融债券利息；三、按照国家统一规定发给的补贴、津贴；四、福利费、抚恤金、救济金；五、保险赔款；六、军人的转业费、复员费；七、按照国家统一规定发给干部、职工的安家费、退职费、退休工资、离休工资、离休生活补助费；八、依照我国有关法律规定应予免税的各国驻华使馆、领事馆的外交代表、领事官员和其他人员的所得；九、中国政府参加的国际公约、签订的协议中规定免税的所得；十、经国务院财政部门批准免税的所得。
3、新个人所得税申报系统怎么申报？
扣缴义务人每月或者每次预扣、代扣的税款，应当在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送扣缴个人所得税申报表。逾期将加收滞纳金并根据《税收征收管理法》的有关规定，税务机关将责令限期改正，并按照规定依法对该单位进行行政处罚。如果本次申报成功后，没有立即缴款，系统在下次登录启动后，首页会弹出缴款的提醒，引导用户进行税款缴纳工作，点击立即缴款即可跳转至网上缴款菜单，这时候系统会获取相关的三方协议和欠税信息，获取成功后在系统前台进行展示，展示的内容包括：所得月份、征收品目、应补退税额等等