2001年3月14日，江西省人民政府、南昌市人民政府与清华大学在北京签订《江西省人民政府和清华大学关于建立清华科技园（江西）的协议》。同年9月26日，清华科技园（江西）发展有限责任公司正式注册成立，负责清华科技园（江西）的建设、经营和管理。
根据《协议》精神，清华科技园（江西）将建设成为“四个中心、一个基地”：
1、高新技术成果及企业孵化中心。
2、高科技项目研究开发中心。
3、高级管理及技术人才培训中心。
4、国际学术及信息交流中心。
5、高新技术成果产业化示范基地。
2001年10月18日，清华科技园（江西）奠基典礼在国家南昌经济技术开发区隆重举行，清华科技园（江西）正式落户江西。2002年2月28日清华科技园（江西）首期建设工程开工仪式隆重举行，园区建设工程全面铺开。清华科技园（江西）占地450亩（其中南区300亩，北区112亩，待征土地38亩），规划总用地30公顷，总建筑面积30万M2，集办公、生活、孵化研发、中试加工及教育培训等功能于一体。