旧设备进口报关资料整理的操作流程如下：
1. 准备进口文件：进口代理需要准备进口合同、发票、装箱单、提单、保险单等文件。
2. 缴纳关税和增值税：进口代理需要向海关缴纳关税和增值税。
3. 办理报关手续：进口代理需要向海关提交进口申报单，并提供相关资料，如进口合同、发票、装箱单等。
4. 办理检验检疫手续：如果进口的旧设备需要进行检验检疫，进口代理需要向检验检疫部门申请，并提供相关资料。
5. 办理进口许可证：如果进口的旧设备需要获得进口许可证，进口代理需要向相关部门申请并办理。
6. 办理货物提取手续：当货物到达目的地后，进口代理需要办理货物提取手续，包括提取货物、缴纳相关费用等。
7. 办理清关手续：最后，进口代理需要向海关办理清关手续，包括验货、核对单证、缴纳税款等。