山东管理科学研究院是山东省政府批准独立设立、省民政厅注册、山东省社会科学界联合会主管的，以管理科学为主要研究对象，涵盖经济管理、社会管理各领域的一家社会科学智库机构。目前直管、代管、运营机构包括：山东省经济学会、山东省品牌建设指导委员会、山东省管理咨询与培训业联合会、中华儒商学院（大陆事务处）、山东省品牌价值评价实验室（省重点实验室）、山东省最具投资价值中小企业评价实验室、中国青年高级人才培训中心山东管理中心、中国青年创业学院山东分院、中国策划协会山东省管理委员会、《管理与创新》杂志社、《山东省经济年鉴》编辑部等
研究院直属机构包括：
3个处室：科研处（学术委员会）、办公室（人事后勤处）、信息资料编辑室(网络中心)；另独立设立山东省经济学会秘书处；
5个研究所：品牌管理研究所、国学智慧研究所、战略管理研究所、中小企业合作研究所、管理创新研究所；
2个研究中心：高校就业指导研究中心、企业管理咨询与培训研究中心；
1个高级人才教育中心：MBA、DBA学位班；国学EMBA学历学位班；高级经理进修证书班；
2个编辑部：《管理与创新》编辑部、《山东省经济年鉴》编辑部；
1所商学院：中华儒商学院大陆教学中心(www.ccbedu.org)
2个基金会：国际儒商投资基金（ICBF）、山东管理科学基金
3个境外办事处：香港、澳大利亚、英国
2007年社会力量协办研究机构包括：
4个研究所：金融证券管理研究所、风险与危机管理研究所、项目管理研究所、信用管理研究所；
1个研究中心：中国式管理研究中心；
2008-2009年拟继续与社会力量合办的研究机构包括：
人力资源研究所
瓶颈管理研究所
区域经济研究所
市场营销研究所
供应链（物流）管理研究所
房地产开发研究所
策划科学研究所
企业文化研究所
职业生涯规划研究所
鲁商研究中心
青年创业指导服务中心；等等
2008年拟在各地扩展的分设研究机构包括：
山东17地市分院(各行业研究所、专业研究所)
驻深圳、北京、上海、西安、重庆、大连办事处
驻台湾、俄罗斯、美国办事处
社会力量协办、合办研究机构条件：
1、经境内设区的市以上人民政府、民政局、工商局批准、注册的社团法人、企业法人机构；
2、热爱管理科学研究、服务工作，在拟从事的研究开发领域有独特的优势、思路或成果,计划方案可行；
3、有良好的社会知名度和声誉；
4、有固定的办公场地、设备和团队；
5、自有资金50万人民币以上（需审计报告），投资本合作研究项目分别如下：
①境内分院、办事处年预算不少于10万元；年管理费3万元；
②研究所（中心）年预算不少于 5 万元；年管理费1万元；
③境外机构由研究院直接投资设立、必须完成相关委派项目。