一、员工损害公司财产怎么处理
员工损害公司财产处理是用人单位可从员工每月工资中扣除所造成的经济损失，但每月扣除的部分最多不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按当地月最低工资标准支付给劳动者工资。
《中华人民共和国民法典》第一千一百六十五条行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。依照法律规定推定行为人有过错，其不能证明自己没有过错的，应当承担侵权责任。
二、公司起诉员工损害公司利益应该准备哪些材料?
1.起诉状一份并按被告的人数提供副本。起诉状正本和副本均必须提供原件,原告为个人的必须亲笔在具状人一栏中签名,原告为单位的,由法定代表人(或负责人)签名并加盖单位公章。
2.主要证据材料,并按被告的人数提供副本(复印件)。
3.原、被告的身份证明。
4.如委托他人诉讼,另须提交授权明确的授权委托书及受托人身份证复印件各1份,并同时提供原件供查验。
5.如委托律师诉讼的,则另须提交授权明确的授权委托书及律师事务所接收委托的证明、函件和律师证复印件。
三、员工侵犯公司财产损害赔偿诉讼时效
财产损害赔偿诉讼时效为3年，自知道或应当知道之日起算，有无人身损害不影响财产损害赔偿的请求时效。
《民法典》第一百八十八条
【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。