一、福建石蛙养殖在以下几个难点
1、配套饲料难。
石蛙是典型两栖动物，按照生长阶段分为蝌蚪期、幼蛙期和成蛙期。蝌蚪阶段生活在水中，其食性较杂，期间摄食不同的营养会影响到蝌蚪的生长以及能否变态成功。在自然环境下，蝌蝌将找到适合自己营养需求的食物。然而，在培养的情况下，饲料基本上来自人工制备。在没有充分了解觅食的情况下，喂养任何种类的食物都会导致不同的耕作效果。因此，在管理上存在非常大的不确定性。另外，不同的食物能量积累对蝌蚪接下来的变态也会产生重大影响。投喂植物性食物过多，蝌蚪变态时间长，变态后体质较差；投喂动物性食物过多则存在营养过剩，导致变态困难，甚至不变态。石蛙蝌蚪营养需求仍然是个难题。
另外，对于福建石蛙养殖模式也大多模仿野生环境来开展。无论从环境创造或食物匹配是一种不同的模仿。你对石蛙的了解越多，成功率就越高，但失败了。大多数人。失败的原因有很多。其中一个重点是对石蛙营养的了解是不够的，甚至是误解造成的。大量营养性疾病。早期研究调查表明，石蛙在野生环境中以昆虫、无脊椎动物、脊椎动物还有草和树叶为食。鉴于食物的易得性，养殖者大多采用黄粉虫作为石蛙主要食物来源。黄粉虫不仅营养丰富，而且产量巨大，且主产区集中在山东境内。于是有人专门从事鲜虫的运输，将山东鲜虫千里迢迢运送到南方山区石蛙养殖者手中。养殖石蛙以黄粉蠕虫的营养来源导致两个结果：繁殖石蛙的成本很高，一年内养了一磅石蛙。成本超过40元，养殖户负担重。其次，黄粉虫为高蛋白食物，石蛙长期吃食会蛋白营养过发生中毒;同时，由于黄粉虫的营养不完全，它带来了各种营养缺乏的石蛙病。所以，对于如何配套石蛙营养，还有很多基础性研究工作要做。
2、福建石蛙养殖环境要求苛刻。
石蛙分布于我国南方地区，常栖息于海拔150～1000米的密林峡谷中间，昼伏夜出，喜在水上觅食，畏烈日。每年11月底至翌年3月中旬为冬眠期。根据石蛙的自然分布可以看出，石蛙繁殖环境需要一年四季建立一个高海拔和水流的地方。需要极大的投资。另外，石蛙对温度和光照有严格的需求，不同发育阶段需求也不同。蝌蚪期水温高于26℃就会影响成活率和变态率；而水温低于18℃则变态缓慢，变态率低。成蛙对环境要求也较高。石蛙昼伏夜出，傍晚时爬出洞穴，晚上异常活跃，但其活动范围不大，多在洞穴周围20米范围活动，白天则潜伏于石穴或草丛中。另外，还具有畏光怕声、惧寒怕热等特点。因此，在养殖过程中如何选址、如何营造石蛙适宜生存的环境是一门很深的学问，只有在深入了解的基础上才有成功的可能性。当前家庭式养殖大多实施设备简陋，难以满足石蛙基本养殖的需要，因此没有可持续发展的能力。
3、科研力量投入不足，基础研究匮乏。
目前已有不少关于福建石蛙养殖与研究的报道，从20世纪80年代初，福建、江西等地开始有人尝试驯养石蛙的报道，到安徽，江苏，湖北，浙江，云南，贵州，广东等省人工饲养的石蛙。行相关的养殖尝试。然而由于大多以捕捞野生群体自繁自养，缺乏科学选种、繁育亲本群体过小、近亲繁殖等，造成了较为严重的种质退化，导致生长缓慢、病害频发，严重制约着石蛙的大面积推广养殖。另外，石蛙的地理群体间遗传分化明显，各自然分布区栖息环境和气候条件差异很大，地理人口的遗传背景严重缺乏。这些都受到严重影响。石蛙资源的合理开发与利用。
在研究方面，杨伟国和陈国英等1990年对石蛙的在田间调查生态习性和生物学特性，为石蛙研究打开了一扇门;其次是丁松林的研究人员2008年开始对石蛙繁育特性和人工养殖进行了研究。后面接着有学者相继在石蛙疾病和养殖方面开展研究。然而，纵观石蛙养殖和研究历史，会发现研究大多比较零散且不成体系，没有专门的学者或机构持续专门从事石蛙这项事业。科研的缺位以及行业发展的不成熟，导致石蛙产业依然处在起步阶段。
4、市场推广难。
虽然石蛙已被写入古代药典作为宝贵的山宝和自古以来的滋补品，但现代人很少有人知道。道也极其有限，尤其是生活在大都市的人们，更加难以接触到石蛙。如何将这山珍美味送到城市，并且让城市居住人们了解它，爱上它，还需要更多更大的投入。
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